An jeder der vier Fakultäten der Uni Salzburg gibt es eine Fakultätsvertretung (FV) der ÖH. Diese werden im Zuge der ÖH-Wahlen von den Studienvertretungen der jeweiligen Fakultät neu entsandt. Sie bestehen aus 11 MandatarInnen und einem von diesen gewählten Vorsitzteam aus drei Personen.

Die Fakultätsvertretungen erfüllen mehrere Aufgaben. Sie unterstützen studentische Projekte unterschiedlichster Art durch organisatorische, logistische oder finanzielle Mitwirkung. Weiters fördern sie die Vernetzung der STVen und den Austausch innerhalb der ÖH. An ihren Standorten arbeiten sie an der Schaffung eines studierendenfreundlichen Umfelds, etwa durch neue Aufenthaltsbereiche oder bessere Infrastruktur.