An jeder der sechs Fakultäten der Uni Salzburg gibt es eine Fakultätsvertretung (FV) der ÖH. Zusätlich gibt es eine FV für die School of Education (FV SoE). Die Fakultätsvertretungen werden im Zuge der ÖH-Wahlen von den Studienvertretungen der jeweiligen Fakultät neu entsandt. Die somit entsandten Mandatar_innen wählen aus ihren Reihen ein Vorsitzteam aus drei Personen.

Die Fakultätsvertretungen erfüllen mehrere Aufgaben. Sie unterstützen studentische Projekte unterschiedlichster Art durch organisatorische, logistische oder finanzielle Mitwirkung. Weiters fördern sie die Vernetzung der STVen und den Austausch innerhalb der ÖH. An ihren Standorten arbeiten sie an der Schaffung eines studierendenfreundlichen Umfelds, etwa durch neue Aufenthaltsbereiche oder bessere Infrastruktur.